مرکز تحقیقات پاتولوژی و سلول‌های بنیادی دانشکده پزشکی افضلی پور با همت معاونت علمی و فناوری ریاست جمهوری، معاونت پژوهشی وزارت بهداشت، معاونت پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی کرمان و جمعی از اعضای هیئت‌ علمی این دانشگاه با دریافت موافقت اصولی در رابطه با راه‌اندازی این مجموعه در سال 1394 شروع به کار کرد. مرکز تحقیقات پاتولوژی و سلول‌های بنیادی دارای بخش‌های متعددی نظیر کشت سلول، مولکولار پاتولوژی، وسترن بلات، فلوسایتومتری، هیستوپاتولوژی و Clean Room است و همچنین قابلیت ارائه خدمات تشخیصی-درمانی مانند BCR-ABL,JAK2,HLATyping,Karyotyping,Fish,Cish و BK را نیز دارد. لازم به ذکر است که این مرکز فعالیت‌های مؤثری در ارائه طرح‌های تحقیقاتی و پایان‌نامه‌ها با محوریت موضوعی پاتولوژی، سلولی و مولکولی داشته که برآیند این فعالیت‌ها چاپ مقالات متعدد در ژورنال‌های معتبر بین‌المللی و همکاری در پیشبرد طرح های پژوهشی با سایر مراکز تحقیقاتی، دانشکده ها و گروه‌های آموزشی دانشگاه علوم پزشکی کرمان و دانشگاه شهید باهنر کرمان بوده است. مرکز در طی سال‌های اخیر، موفق به جذب دانشجوی PhD by Research و نیروی انسانی طرحی نیز شده است. برگزاری دو کنگره بین‌المللی پزشکی افضلی پور پیرامون پاتولوژی در سال‌های 1394 و 1397 در کرمان نیز از افتخارات دیگر این مرکز است. برگزاری کارگاه های متعدد در زمینه تکنیک‌های سلولی و موکولی مختلف نیز از دیگر اقدامات این مرکز می باشد. این مرکز در نظر دارد به عنوان یک زیر مجموعه از دانشگاه علوم پزشکی کرمان بتواند از طریق همکاری با هسته های فناور گامی بلند در پیشرفت علم و فناوری و توسعه اقتصاد دانش بنیان کشور بردارد.